Многие тысячелетия назад, в пустыне Сахара имелось достаточное количество источников воды, которые сейчас погребены под толщей песков, поэтому в те времена люди и животные могли довольно безбедно жить там, в особенности на окраинах самой большой в мире пустыни. Согласно многим находкам и источникам, здесь в довольно большом количестве водились водные животные, в том числе крокодилы.Некоторые находки также обнаружили тот факт, что на территории Сахары в незапамятные времена обитали динозавры. Доисторические наскальные надписи наглядно демонстрируют, что в этой пустыне нередко можно было встретить крупный рогатый скот, львов, жирафов, а также слонов, которые обитали в оазисах, в то время очень многочисленных.

В настоящее время Сахара является в самом прямом смысле пустыней, поскольку из-за практически полного отсутствия в ней источников воды, а соответственно, ничтожно малого количества оазисов, представителей местной фауны и растительности можно буквально пересчитать по пальцам. Эта перемена произошла приблизительно в 1600 году до нашей эры, когда случился сдвиг земных плит. Исключением является только долина священного Нила, несколько оазисов, а также плоскогорье в северной части Сахары, причем на последнем можно встретить такие совершенно немыслимые для пустыни растения, как оливковые деревья.

Верблюды, которые неизменно ассоциируются с Сахарой, появились здесь только около двухсотого года нашей эры, когда кочевники и ведущие караванов полностью осознали их преимущества перед лошадьми, ведь эти корабли пустыни не ощущают никакого дискомфорта от песка и палящего солнца, а также могут идти довольно быстро, не требуя при этом регулярной пищи и питья. Очень вольготно чувствуют себя в пустынном климате Сахары такие животные, как змеи и скорпионы, коих тут великое множество. Причем подавляющее большинство их являются чрезвычайно ядовитыми.

Среди млекопитающих Сахары самым крупным видом является криворогая антилопа, которая обитает там небольшими стадами. Среди хищников в Сахаре нередко встречаются шакалы, а также некоторые виды гиен, а в туннелях, прорытых в дюнах, обитает маленькая лиса-фенек, которая выходит на охоту только ночью.