Экспозиция музея, расположенная на первом этаже, организована очень логично. Она перетекает из эпохи в эпоху в строгой последовательности. Из нее выбивается только центральный зал, расположенный у входа в музей. В этом колоссальном зале с устремленными ввысь сводами размещены самые крупные из всех экспонатов. В нем находится статуя фараона Джосера — древнейшая находка, обнаруженная в Саккаре, датируемая XXVII веком до н. э.!
Здесь же, в центральном холле установлена копия известного Розеттского камня (в свое время оригинал был вывезен в Британию). Надписи на нем позволили ученым впервые расшифровать систему древнеегипетских иероглифов, а также научиться читать древнейшие письмена. Экспозиция на первом этаже разделена по секторам и залам: Древнее царство, Среднее, Новое царство, греко-римская эпоха и т. п.
Отдельно следует сказать о так называемой Амарнской галерее, в которой выставлены находки времен царствования царя-еретика Эхнатона, который придумал новую религию солнцепоклонничества. И именно среди экспонатов этой галереи находится скульптурное изображение известного на весь мир бюста, принадлежащего жене Эхнатона — прекрасной царице Нефертити.
